衛生檢驗係公共衛生工作之基石，實驗室之各項檢驗結果，常作為行政處分判定之依據，而檢驗品質更是決定檢驗報告可信度之重要關鍵，因此實驗室是否通過具有第三方公信力單位之認證，是一個相當重要之指標。
本局積極推動各項實驗室品質提昇及實驗室認證作業，以提供具公信力的檢驗報告，逐年增加檢驗項目及新增精密檢驗儀器並加強人員專業訓練，強化檢驗機制以提供最優質的檢驗品質保證。
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FDA實驗室
認證
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TAF實驗室
認證
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CDC認可實驗室
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衛生福利部指定之濫用藥物尿液檢驗衛生機關
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防腐劑12項
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殘留農藥380項
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登革熱-確認4項
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海洛因、鴉片代謝物: 2項
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甜味劑13項
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乙型受體素
21項
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梅毒-確認
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安非他命類藥物:
4項
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亞硝酸鹽1項
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二硫代胺基甲酸鹽類1項
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梅毒-篩檢
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大麻代謝物: 1項
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過氧化氫1項
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水質大腸桿菌
1項
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HIV-篩檢
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愷他命代謝物:
2項
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硼砂1項
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生菌數1項
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HIV-確認 |
苯二氮平類: 5項
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二氧化硫1項
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COVID-19-確認 |
卡西酮類: 6項
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乙型受體素21項
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苯乙胺類: 2項
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殘留農藥380項
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氯胺酮類: 2項 | ||
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二硫代胺基甲酸鹽類1項
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黃麴毒素4項
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水中溴酸鹽1項
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水產動物類中重金屬(鉛、鎘)2項
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水產動物類中甲基汞
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動物用藥多重殘留48項
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中藥及食品中摻加西藥232項
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生菌數1項
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大腸桿菌1項
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大腸桿菌群1項
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腸桿菌科
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黃豆基改13項
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動物性成分-定性篩選1項
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動物性成分-豬
1項
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動物性成分-雞
1項
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動物性成分 -牛
1項
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動物性成分-羊檢驗1項
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植物性成分(洋蔥、蔥、蒜、韭、蕎)1項
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禽畜農藥(129項)
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食品中溴酸鹽
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抗生素及其代謝物多重殘留分析
(畜產水產品)16項
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抗生素及其代謝物多重殘留分析(二)
(乳汁)16項
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總計30類
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總計5類
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總計6類
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總計8類
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本局為衛生福利部食品藥物管理署(TFDA)、財團法人全國認證基金會(TAF)及疾病管制署（CDC）等機構之認證（認可、指定）實驗室，並通過國內外各項檢驗能力試驗，檢驗品質符合國際規範，檢驗能力與國際並駕齊驅。
